Đối với kiểm soát dư lượng thuốc BVTV trong nông sản và thực phẩm lưu hành trong thị trường Việt Nam phải tuân thủ theo Thông tư số 50/2016/TT-BYT: Quy định giới hạn tối đa dư lượng thuốc bảo vệ thực vật trong thực phẩm. Ngoài các hoạt chất cho phép sử dụng, Bộ nông nghiệp cũng ban hành danh sách các hoạt chất cấm sử dụng tương ứng với các quy định sau: